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标题: vmd中怎么让所有原子处在盒子的中央 [打印本页]

作者
Author: zhangs 时间: 2024-6-25 11:08
标题: vmd中怎么让所有原子处在盒子的中央
请教下各位老师，vmd中怎么让所有原子处在盒子的中央，我使用了这个命令后pbc box -center origin -shiftcenter {-1 -1 0}，保存了在打开盒子会发生偏移
(, 下载次数 Times of downloads: 8)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-26 02:59
Multiwfn里有现成的在盒子里居中的功能。打开gro文件，处理后再保存gro文件
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610（http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html）

作者
Author: MUMBER 时间: 前天 15:23
可以用这段命令：
set a [atomselect top all]
set coor [vecinvert [measure center $a]]
$a moveby $coor

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