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标题: 使用sobEDAw对含氢键结构的复合物能量分解存在的问题 [打印本页]

作者
Author: sharan1994 时间: 2024-6-28 15:39
标题: 使用sobEDAw对含氢键结构的复合物能量分解存在的问题
我想对两个氢键复合物进行能量分解分析，得出形成氢键的各项作用能占比。我根据教程使用sobEDAw进行计算后得出了一些数据，但是通过IGMH图形化发现这两个结构的相互作用不光有羟基形成的氢键，还有苯环之间的范德华作用（CH2OH-PI图像更明显，有两个绿块），现在有2个疑问想请教大家：
1：我用sobEDAw分解的是总的相互作用能而不是单纯的氢键吗？（我推测苯环间的作用会导致色散作用占比上升，虽然这个弱氢键是以色散为主）
2：如果我只想得到单纯氢键结构的能量分解，怎么操作能实现？我设想了两种思路，（1）在fragment.txt中只填上形成氢键的三个原子的序号；（2）对氢键复合物使用Multiwfn再进行一次“原子对色散能的贡献”计算，得出形成非氢键区域（第二块绿色区域）的原子的色散作用能，再按比例在sobEDAw计算的结果中的色散作用能中减去，得出一个只有氢键的色散作用能。
谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-28 18:08
1 是
2 (1)没有意义，相当于用一个诡异的结构计算。(2)并不严格，因为非氢键作用区域除了色散相互作用外也对静电、交换互斥有贡献

作者
Author: sharan1994 时间: 2024-6-29 13:08

sobereva 发表于 2024-6-28 18:08
1 是
2 (1)没有意义，相当于用一个诡异的结构计算。(2)并不严格，因为非氢键作用区域除了色散相互作用外也 ...

好的谢谢卢老师我看想想其他办法解释

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