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标题: MM/PBSA结合能计算显示MoleculeError: Cannot bond two virtual sites/extra point... [打印本页]

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Author: dxf 时间: 2024-6-30 20:04
标题: MM/PBSA结合能计算显示MoleculeError: Cannot bond two virtual sites/extra point...
按照教程https://valdes-tresanco-ms.github.io/gmx_MMPBSA/已成功安装gmx_mmpbsa
输入以下命令报错：mpirun -np 16 gmx_MMPBSA MPI -O -i mmpbsa.in -cs md_50.tpr -cp topol.top -ci index.ndx -cg 1 13 -ct md_noPDB.xtc -o energy.dat -do FINAL_DECOMP_MMPBSA.dat -nogui && gmx_MMPBSA --clean

报错为：MoleculeError: Cannot bond two virtual sites/extra points together

请各位大神帮帮忙！！！

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