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标题: gmx_MMPBSA计算过程中出现报错 [打印本页]

作者
Author: 12313 时间: 2024-7-1 10:04
标题: gmx_MMPBSA计算过程中出现报错
各位老师好，我计算的体系是蛋白配体体系，所使用的gmx_MMPBSA版本是v1.6.2，虚拟环境中安装的gmx版本是2021.3，机子CPU逻辑核数为64
输入的指令是mpirun -np 64 gmx_MMPBSA MPI -O -i mmpbsa.in -cs mdo1.tpr -ci index.ndx -cg 1 13 -ct md01.xtc -cp topol.top -o FINAL_RESULTS.dat -eo FINAL_RESULTS.csv.其中md01.tpr/md01.xtc/index.ndx/topol.top均由gmx2018.8算得，报错如下图，想问一下老师们该如何解决？
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作者
Author: UPL_JUN 时间: 2025-6-13 11:13
有一种情况会出现这种报错，使用并行计算对RAM的占用非常高（在我的体系下4核吃满32G非常容易）导致退出。可以尝试减小核数。

作者
Author: pkuchemistry 时间: 2025-6-13 12:49
检查脚本是不是有问题，下载官方的。

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