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标题: CP2K对200原子体系振动分析出现内存不足问题 [打印本页]

作者
Author: Alset 时间: 2024-7-1 20:45
标题: CP2K对200原子体系振动分析出现内存不足问题
本帖最后由 Alset 于 2024-7-1 20:48 编辑

各位老师们好，

我打算用cp2k对64个水分子体系进行振动分析计算。计算级别是revPBE(D3)+TZV2P-MOLOPT-GTH。但是在任务运行片刻后出现了内存不足的报错。

我参考公社上过往的帖子，将提交命令改为mpirun -np 2 -env OMP_NUM_THREADS=16 cp2k.psmp vib.inp |tee vib.out （如果使用-x而非-env会出现报错)，同时.inp文件NPROC_REP 为1，提交会报错，只有-np为1时可以正常跑下去，但是速度极慢。我使用free -m | grep '^Mem' >> mem.log对内存使用情况进行检测，mem.log记录到最后的内存使用为220GB，已经十分接近节点最大内存256GB。

还有一个问题是，我准备了不同的样本（在不同压力下进行几何优化，其余设置完全相同），部分样本可以正常运行振动分析，不会出现内存问题，而个别则会出现内存问题。

请问各位老师有什么建议吗？

输入、输出文件，提交脚本以及内存监测文件都已经贴在附件。

作者
Author: 计算消白 时间: 2025-11-15 01:36
你好，问题解决了吗？我也遇到类似的内存不足问题

作者
Author: reid 时间: 2025-11-15 23:53
体系不算大，但是使用的基组有点大了，建议用与结构优化相同的基组。另外，应当设置NPROC_REP，不要用1个核跑，你这应当用多个核跑

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