计算化学公社

标题: 求助IRC分析研究反应机理，atom coordination什么意思 [打印本页]

作者
Author: karl 时间: 2024-7-2 09:07
标题: 求助IRC分析研究反应机理，atom coordination什么意思
通过IRC分析研究反应机理，审稿人提出 In SI, there is no addition energy and atom coordination information about this study. 能量信息是因为我做了一张图，给出了反应能垒，没有给出具体的能量值。但是请问一下，atom coordination information是什么意思，我应当怎么获取？

作者
Author: Dyyyzz 时间: 2024-7-2 09:20
他想说的应该是原子坐标吧。

作者
Author: karl 时间: 2024-7-2 09:35

Dyyyzz 发表于 2024-7-2 09:20
他想说的应该是原子坐标吧。

谢谢！我的第一反应也是原子坐标coordinate 但是仔细看了一下是coordination 配位的意思

作者
Author: wxyhgk 时间: 2024-7-2 11:45
我猜测可能是要你的过渡态的里面的一些信息吧，比如

1. 反应物、中间体和产物中的原子之间的距离
2. 配位原子周围直接相邻的其他原子的数量

作者
Author: sai77 时间: 2024-7-2 12:04

karl 发表于 2024-7-2 09:35
谢谢！我的第一反应也是原子坐标coordinate 但是仔细看了一下是coordination 配位的意思

显然就是坐标的意思

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-2 20:58
现在很多计算文章都会把整个研究牵扯到的所有驻点结构的坐标放到SI里，从而便于读者重复数据，例如下文提到的研究文章。当前语境下显然就是指原子坐标
18碳环等电子体B6N6C6独特的芳香性：揭示碳原子桥联硼-氮对电子离域的关键影响
http://sobereva.com/696（http://bbs.keinsci.com/thread-42891-1-1.html）
揭示各种新奇的碳环体系的振动特征
http://sobereva.com/578（http://bbs.keinsci.com/thread-20919-1-1.html）

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