计算化学公社

标题: AIMD的NpT系综如何设置langevin atoms [打印本页]

作者
Author: XIEH 时间: 2024-7-3 11:28
标题: AIMD的NpT系综如何设置langevin atoms
最近想模拟一个NpT系综，看手册了解到 langevin 恒温器有fixed原子和langevin原子之分，
比如手册给的例子POSCAR中要写：Si H Si
40 16 8
那么是不是就意味着POSCAR中最下面八行的坐标就是这八个langevin atoms？
还是借用手册这个例子，如果写：Si H Si H
40 10 8 6
POSCAR最后14行是不是要为8个Si和6个H的坐标？

如果是我想的这样来指定langevin atoms，有没有大佬能分享一个按Z坐标从小到大重新编号原子的脚本呢？

作者
Author: herui 时间: 2024-12-14 17:34
这个问题希望从原理去理解参数，才能正确设置参数

作者
Author: XIEH 时间: 2025-1-4 11:26

herui 发表于 2024-12-14 17:34
这个问题希望从原理去理解参数，才能正确设置参数

emmm我不否认你说的
但是我的疑惑是VASP程序如何从POSCAR中识别哪些是langevin atoms

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)