计算化学公社
标题:
请教区分polar surface和polar slab以及pymatgen模块处理slab的相关问题
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作者Author:
Jiongci-21
时间:
2024-7-8 11:46
标题:
请教区分polar surface和polar slab以及pymatgen模块处理slab的相关问题
社友们好,
首先我感觉 polar surface 应该和固体物理和表面物理相关,所以斗胆直接在物理学区开贴,如果有什么不对的地方还请批评指正。
我最近在用pymatgen.core.surface module 处理生成一些rock salt晶体的表面。以经典的NaCl为例,当我切了(1 1 1)面并生成了一定厚度的surface slab model(如图1,slab上下面非对称),调用is_polar()函数的时候,结果显示是极性的(is_polar()介绍说这个是检查slab是否是极性的)。但是当我添加了symmetrize=True 参数后,生成的slab被强制为对称的上下面(如图2),is_polar()的结果就是非极性了。我能理解NaCl的(1 1 1)面由于表面存在net dipole density肯定是极性面,但是我不太理解 polar surface 和 polar slab 之间的关系和区别。
J. Neugebauer and M. Scheffler, Phys. Rev. B
46
, 16067 (1992) 这篇文章里提到了asymmetric slab,是否只要是非对称的slab都是polar slab?
我接下来要对这些slab进行DFT计算优化,请问我该怎么判别哪些slab需要添加dipole correction?我最大的疑惑是,是否只要是polar surface 就必须添加dipole correction?还是说我做了symmetrize=True的处理后,得到non-polar slab,就不需要添加dipole correction了呢?
希望有懂的社友多多赐教,提供一些阅读的材料,万分感谢。
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图 1 symmetrize=False 以及生成的NaCl (111) slab。
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图 2 symmetrize=False 以及生成Na-terminal 和 Cl-terminal 的两个NaCl (111) 上下对称的slabs。
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