计算化学公社

标题: 对xpm文件进行可视化，除了使用xpm2ps命令，还有没有别的方法？ [打印本页]

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Author: 12313 时间: 2024-7-10 12:42
标题: 对xpm文件进行可视化，除了使用xpm2ps命令，还有没有别的方法？
各位老师好，我用sham命令生成了gibbs.xpm文件，在后续使用xpm2ps命令获得eps文件后，感觉图片不是很美观，想问一下还有没有别的什么方法可以得到比较美观的图片

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Author: sobereva 时间: 2024-7-10 15:24
http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html

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Author: wangs 时间: 2024-7-10 16:15
DuIvyTools

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Author: 12313 时间: 2024-7-10 16:51

sobereva 发表于 2024-7-10 15:24
http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html

老师，我下载了链接中的plot_xpm.py脚本，然后在cmd中输入python plot_xpm.py gibbs.xpm，但是得到这样的报错,这是什么原因呢？
(, 下载次数 Times of downloads: 34)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-10 23:14

12313 发表于 2024-7-10 16:51
老师，我下载了链接中的plot_xpm.py脚本，然后在cmd中输入python plot_xpm.py gibbs.xpm，但是得到这样的 ...

我没用过，在相应帖子里问

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-7-11 08:05

12313 发表于 2024-7-10 16:51
老师，我下载了链接中的plot_xpm.py脚本，然后在cmd中输入python plot_xpm.py gibbs.xpm，但是得到这样的 ...

#!/bin/bash

for i in `ls *.xpm`
do
echo "Convert $i..."
python plot_xpm.py $i
if [[ "hbmap ss" =~ ${i/.xpm/} ]];then
      t=
elif [[ "densmap rmsd residue" =~ ${i/.xpm/} ]];then
      t="-rainbow blue"
else
      t="-rainbow red"
fi
# this is for windows platform
./gmx_xpm2ps.exe -f $i -o ${i/.xpm/}.eps $t > /dev/null 2>&1
done

你保存成.sh文件，然后运行下

作者
Author: 12313 时间: 2024-7-11 10:06

dayu8278 发表于 2024-7-11 08:05
#!/bin/bash

for i in `ls *.xpm`

我保存成.sh文件了老师，但是我在windows的命令窗口下该怎么输入命令啊？

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-7-11 19:37

12313 发表于 2024-7-11 10:06
我保存成.sh文件了老师，但是我在windows的命令窗口下该怎么输入命令啊？

windows我不熟，linux系统下直接sh就可以了

作者
Author: 12313 时间: 2024-7-12 09:23

dayu8278 发表于 2024-7-11 19:37
windows我不熟，linux系统下直接sh就可以了

老师，我在linux系统下用sh试了一下，但是出错了，不知道是不是我输得命令有错啊
(, 下载次数 Times of downloads: 30)

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Author: dayu8278 时间: 2024-7-12 09:37

12313 发表于 2024-7-12 09:23
老师，我在linux系统下用sh试了一下，但是出错了，不知道是不是我输得命令有错啊

不应该直接运行sh就可以了吗，为啥后面要跟着xpm呢

作者
Author: 12313 时间: 2024-7-12 17:43

dayu8278 发表于 2024-7-12 09:37
不应该直接运行sh就可以了吗，为啥后面要跟着xpm呢

xpm是我的输入文件，而且我只输入sh plot.sh也得到了同样的报错

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