计算化学公社

标题: IRC其中一个端点相关的计算问题 [打印本页]

作者
Author: szy929 时间: 2024-7-11 19:02
标题: IRC其中一个端点相关的计算问题
最近在跑irc的时候发现一个问题，以过渡态最后一个构象作为irc的输入文件进行计算，产物确实是我想要的结构，但是另一个端点的产物跑出来的是羟基自由基接到苯环上了，而我加入的是游离态的羟基自由基，这样结果是正确的吗？如果正确的话，游离态和羟基自由基接到苯环上的状态，这两个状态计算自由能是等同的吗？如果不正确的话，是哪里出了问题，应该怎么改文件呢？提前谢过各位大佬指点

作者
Author: imasen 时间: 2024-7-11 22:25
你现在找到的是水分子加成到苯环上的过渡态，和羟基自由基的反应没关系。如果你想做的是苯Π55自由基和羟基自由基偶合的过渡态，首先这个过渡态可能并不存在，如果存在你的过渡态应该是三重态或者自旋极化单重态。

作者
Author: szy929 时间: 2024-7-12 13:40

imasen 发表于 2024-7-11 22:25
你现在找到的是水分子加成到苯环上的过渡态，和羟基自由基的反应没关系。如果你想做的是苯Π55自由基和羟基 ...

我一开始预想的是羟基自由基先加到酯基的对位上之后，第二步的过渡态是羟基自由基夺掉对位的那个氢生成水和稳定的产物，您的说法是这个第二步可能是个无能垒反应，氢脱去是自发的是吗？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)