计算化学公社

标题: 审稿人问有机自由基自旋污染S2值 [打印本页]

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Zheng123    时间: 2024-7-13 20:52
标题: 审稿人问有机自由基自旋污染S2值
有一条审稿意见提到了有机自由基的S2值在使用CCSD(t)方法时,有机自由基中的s2值会与0.75相差很大,我看了我的pvtz文件在0.75到0.99的都有,这数值正常吗,(DFT计算输出文件的S2值大概都在0.75左右)审稿人说让制成表格。顺便想请教一下这条意见该怎么回复

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zjxitcc    时间: 2024-7-13 21:06
注意,如果你是用的Gaussian做UCCSD(T)计算,输出文件中<S**2>是UHF的,不是UCCSD(T)的,切勿错误指认(给审稿人进一步授之以柄)。如果是二重态自由基,<S**2>为0.99的话,自旋污染不是很大(意思就是偏离理想值0.75不是很多,不是很要紧)。如果结构只有几十个(计算量不大),建议全部检验波函数稳定性(如果不懂这个意思,请在该论坛上搜索,往期有无数帖子提到),然后回复的时候跟审稿人说全部检验过波函数稳定性,并且本文给出的结果 对应的波函数都是稳定的。当然,如果发现某一个不稳定,则要重新计算/继续优化该结构。

正常回复,列表就列表。
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Zheng123    时间: 2024-7-13 21:37
zjxitcc 发表于 2024-7-13 21:06
注意,如果你是用的Gaussian做UCCSD(T)计算,输出文件中是UHF的,不是UCCSD(T)的,切勿错误指认(给审稿人 ...

啊我CCSD(T)计算实在gaussian里做的,那请问这个S2值从哪查找呢,我看了别的帖子误以为<S**2>就是CCSD(t)的s2值
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zjxitcc    时间: 2024-7-13 21:40
Zheng123 发表于 2024-7-13 21:37
啊我CCSD(T)计算实在gaussian里做的,那请问这个S2值从哪查找呢,我看了别的帖子误以为就是CCSD(t)的 ...

据我所知没有程序可以计算UCCSD(T)的<S**2>。你所列的表里要有一行是UHF的<S**2>。
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Zheng123    时间: 2024-7-13 21:55
zjxitcc 发表于 2024-7-13 21:40
据我所知没有程序可以计算UCCSD(T)的。你所列的表里要有一行是UHF的。

好的谢谢 我回复意见里可以这么说吗 列表里放DFT和UHF的
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zjxitcc    时间: 2024-7-13 22:36
Zheng123 发表于 2024-7-13 21:55
好的谢谢 我回复意见里可以这么说吗 列表里放DFT和UHF的

可以,写的时候要写明具体泛函。例如用的是B3LYP泛函,如果是二重态体系,应写明UB3LYP。
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Zheng123    时间: 2024-7-14 19:43
zjxitcc 发表于 2024-7-13 22:36
可以,写的时候要写明具体泛函。例如用的是B3LYP泛函,如果是二重态体系,应写明UB3LYP。

好的 十分感谢!




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