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标题: 是否有Ac,Th等等锕系元素的Grimme参数C6和R0的值？ [打印本页]

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Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-22 09:40
标题: 是否有Ac,Th等等锕系元素的Grimme参数C6和R0的值？
请问是否有Ac,Th等等锕系元素的Grimme参数C6和R0的值？非常感谢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-23 03:27
Grimme参数指代不明
如果是D3或者D4，支持什么元素原文说了，不可能用于其它元素

作者
Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-23 09:53

sobereva 发表于 2024-7-23 03:27
Grimme参数指代不明
如果是D3或者D4，支持什么元素原文说了，不可能用于其它元素

DFT-D3，锕系元素目前在castep等软件没有色散矫正参数，我去UNIVERSITÄT BONN官网里查了DFT-D3的色散参数，但也是只涉及到周期表1-86号，而锕系元素刚好没有，我的计算体系包含锕系元素，并且必须使用色散矫正来修正范德华力，不知道站长有没有这方面的数据

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-24 04:38

zhangbo11011 发表于 2024-7-23 09:53
DFT-D3，锕系元素目前在castep等软件没有色散矫正参数，我去UNIVERSITÄT BONN官网里查了DFT-D3的色 ...

D3参数一直到94号元素都有，覆盖了部分锕系，看D3原文

对于其它元素，参考北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）的ppt：
(, 下载次数 Times of downloads: 36)

作者
Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-24 10:35

sobereva 发表于 2024-7-24 04:38
D3参数一直到94号元素都有，覆盖了部分锕系，看D3原文

对于其它元素，参考北京科音中级量子化学培训班 ...

感谢您的回复，我有了解D3程序包含了（1-94）元素，可是我下载了最新版本的DFT-D3程序代码，里面没有写87-94号的色散系数C6和范德华半径R0，不知道是不是我水平有限而看不出来，D3程序包附上

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-26 03:50

zhangbo11011 发表于 2024-7-24 10:35
感谢您的回复，我有了解D3程序包含了（1-94）元素，可是我下载了最新版本的DFT-D3程序代码，里面没有写87 ...

例如用这个AcTh双原子分子xyz文件作为例子，用独立的dftd3程序，执行dftd3 AcTh.xyz -func b-lyp -bj可以得到色散校正能，可见是支持锕系的
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

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Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-26 18:14
本帖最后由 zhangbo11011 于 2024-7-26 18:15 编辑

sobereva 发表于 2024-7-26 03:50
例如用这个AcTh双原子分子xyz文件作为例子，用独立的dftd3程序，执行dftd3 AcTh.xyz -func b-lyp -bj可以 ...

非常感谢站长回复我，可我想知道Th在N原子之间的色散系数C6和范德华半径R0，我不会使用这个程序，我只会将这个C6和R0写入CASTEP自定义的DFT-D中，然后执行CASTEP的DFT-D进行色散矫正，站在您可以告诉我这个Th元素的C6和R0嘛？最近一直因为这个问题而无法进行几何优化

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-26 23:34

zhangbo11011 发表于 2024-7-26 18:14
非常感谢站长回复我，可我想知道Th在N原子之间的色散系数C6和范德华半径R0，我不会使用这个程序，我只会 ...

C6不是固定的，DFT-D3依赖于配位数计算C6

作者
Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-30 10:53

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-7-28 20:21
这个月17号发布的论文Phys. Chem. Chem. Phys., 2024 (https://doi.org/10.1039/D4CP01514B) 附带的SI应该 ...

我也找到了这篇文章，可是我仔细阅读了支撑材料，发现只有范德华半径R0，可是C6没有发现，您有发现C6的数值嘛？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-7-30 16:07

zhangbo11011 发表于 2024-7-30 10:53
我也找到了这篇文章，可是我仔细阅读了支撑材料，发现只有范德华半径R0，可是C6没有发现，您有发现C6的数 ...

C6还是得按实际化学环境来算。

要简单点就用已有的DFT-D3程序从输出中读取，参考社长的博文《DFT-D色散校正的使用》（http://sobereva.com/210），特别是第3节计算的操作；

要严格点就参考这个月17号专为钫镭和锕系的校正发布的论文Phys. Chem. Chem. Phys., 2024 (https://doi.org/10.1039/D4CP01514B)中的过程，或者社长的博文《使用Multiwfn计算原子的C6色散系数》（http://sobereva.com/709）的方法，从原子极化率出发算。

（前面那个回复太简略，自删了。因水平有限，本帖仅为指路用而无法提供具体协助，还请谅解。）

作者
Author: zhangbo11011 时间: 2024-7-30 18:45

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-7-30 16:07
C6还是得按实际化学环境来算。

要简单点就用已有的DFT-D3程序从输出中读取，参考社长的博文《DFT-D色 ...

感谢您的仔细回复，我仔细参考了PCCP这篇文章关于Th元素的C6和R0，可是C6只有计算公式，没有具体相关配位环境的数值表，只有R0有相关配位环境的具体数值，哎，目前只掌握了R0，另外我去波恩大学官网查询了锕系元素的C6（aa），但只有与本身元素和H元素反应的体系C6，而且单位不明，链接在此：https://www.chemie.uni-bonn.de/g ... /refernce_molecules
还请大佬指明方向

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