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标题: 关于寻找乙烯醇相关反应过渡态时，过渡态发生异构的问题求助 [打印本页]

作者
Author: 400__LUX 时间: 2024-7-22 22:34
标题: 关于寻找乙烯醇相关反应过渡态时，过渡态发生异构的问题求助
本帖最后由 400__LUX 于 2024-7-23 11:39 编辑

本人通过查阅文献发现乙烯醇存在两种构型：顺式乙烯醇和反式乙烯醇，并且文献通过构象搜索表明两者能量十分接近（约1 kcal/mol），互相异构化的能垒很低。在1000K时，顺式和反式的构型依次为：61%和39%。基于此，我想以顺式构型为主，计算小分子进攻顺式乙烯醇脱氢反应过程。以乙烯醇生成CH2C-OH自由基为例，我发现在搜索过渡态的过程中，OH会向外旋转，顺式的CH2C-OH自由基在优化过程中会慢慢变为反式的CH2C-OH自由基，进而在计算IRC后，产物和反应物均变为反式乙烯醇的脱氢过程。尝试采用calcall后，OH依然会旋转。故我的问题如下：

1.在做过渡态的时候是否可以不考虑构型的问题？但如果不考虑，会导致反应物复合物实际能量与IRC计算能量不符，从这个角度来说似乎必须考虑构象的问题。
2.如果想要得到顺式乙烯醇反应的过渡态构型，应该如何进行计算？是否应该对其做构象搜索？
3.如果进行构象搜索，旋转OH键，应该会得到很多构象，过渡态构象应该如何选择，是否是直接选择和产物（顺式CH2C-OH）相同的构象就可以？
目前还未尝试过进行构象搜索，可能描述上存在问题，还请各位大佬帮忙解答指正，谢谢。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-7-22 23:03
本来就不是所有分子的顺式和反式构象都可以直接参与反应，所以这个结果是正常的。
但如果要严格确认顺式乙烯醇确实不能直接反应，可以把C=C-O-H键角以及过渡态生成的键的键长限制住，做构象搜索，再放开限制优化过渡态

作者
Author: 400__LUX 时间: 2024-7-23 11:38

wzkchem5 发表于 2024-7-22 23:03
本来就不是所有分子的顺式和反式构象都可以直接参与反应，所以这个结果是正常的。
但如果要严格确认顺式乙 ...

好的，谢谢老师指点，我尝试一下。

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