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标题: 计算相互作用能方法的选择 [打印本页]

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-20 09:28
标题: 计算相互作用能方法的选择
请问老师，我的优化是在M062X/6-311G**下进行的，然后用这这三种方法进行相互作用能的计算，这可以来证明1，2，3复合物都是稳定的，并且纵向比较稳定性3大于2大于1吗？（复合物是200 C H O N原子）

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-20 12:38
光从这些数据来看可以

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-20 12:57

sobereva 发表于 2016-12-20 12:38
光从这些数据来看可以

谢谢老师的回答。您说过不同方法计算的能量没有可比性，所以此表格不能横向比较，并且也不能说明计算得到的能量越低方法越好（即对此体系B3LYP-d3要比WB97XD和M062X更适合之类的），对吗？老师

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-20 13:22

wweng 发表于 2016-12-20 12:57
谢谢老师的回答。您说过不同方法计算的能量没有可比性，所以此表格不能横向比较，并且也不能说明计算得到 ...

可以横向比较不同方法算出来的相互作用能，不同级别不能比的是绝对能量
谁高谁低没法说明谁好谁不好

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-20 13:45
本帖最后由 wweng 于 2016-12-20 13:48 编辑

sobereva 发表于 2016-12-20 13:22
可以横向比较不同方法算出来的相互作用能，不同级别不能比的是绝对能量
谁高谁低没法说明谁好谁不好

好的，谢谢老师的解答，那就是算出来的相互作用能更大，也不能说明方法更适合对吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 02:32

wweng 发表于 2016-12-20 13:45
好的，谢谢老师的解答，那就是算出来的相互作用能更大，也不能说明方法更适合对吗？

对

根本大小就没法用来判断任何合理性，原理上就没这说法。

作者
Author: teller3531 时间: 2016-12-21 08:44
那sob老师算相互作用能，不同方法的准确性该怎么比较那

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 09:06

teller3531 发表于 2016-12-21 08:44
那sob老师算相互作用能，不同方法的准确性该怎么比较那

看各种弱相互作用的benchmark文章
普通DFT级别中，M06-2X-D3的精度是几乎最高的。在我的《乱谈DFT-D》博文里的方法推荐里有
如果嫌这个还不够，还想更好点，就上比较好的双杂化泛函

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-21 09:27

sobereva 发表于 2016-12-21 09:06
看各种弱相互作用的benchmark文章
普通DFT级别中，M06-2X-D3的精度是几乎最高的。在我的《乱谈DFT-D》博 ...

谢谢老师的耐心讲解！我的体系用的M062X/6-311g**优化，我觉得应该够了，体系大而且多，要再加D3全部优化时间估计也不够用了。所以只是在计算相互作用能的时候多选择了上述两种方法来做

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 09:43

wweng 发表于 2016-12-21 09:27
谢谢老师的耐心讲解！我的体系用的M062X/6-311g**优化，我觉得应该够了，体系大而且多，要再加D3全部优化 ...

优化用这个级别足矣

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-21 09:57

sobereva 发表于 2016-12-21 09:43
优化用这个级别足矣

恩，那老师我优化的时候不加D3，算能量的话可以加吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 09:59

wweng 发表于 2016-12-21 09:57
恩，那老师我优化的时候不加D3，算能量的话可以加吗？

原理上可以。
算能量最好加D3，结果还会有进一步改进，不过一个后患是审稿人可能问你为什么优化不加D3。

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-21 10:09

sobereva 发表于 2016-12-21 09:59
原理上可以。
算能量最好加D3，结果还会有进一步改进，不过一个后患是审稿人可能问你为什么优化不加D3 ...

恩恩，老师正好说中我的担忧，想加上d3再优化下，可时间太紧张，不知道该该怎样做最好。谢谢老师的解答

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 10:38

wweng 发表于 2016-12-21 10:09
恩恩，老师正好说中我的担忧，想加上d3再优化下，可时间太紧张，不知道该该怎样做最好。谢谢老师的解答

不用重新优化，单点索性就甭加D3了

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-21 10:56

sobereva 发表于 2016-12-21 10:38
不用重新优化，单点索性就甭加D3了

好的！谢谢您。对了老师，您前面说的可以横向比较不同方法算出来的相互作用能，是怎样个比较法？一般可以得出些什么呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-21 12:08

wweng 发表于 2016-12-21 10:56
好的！谢谢您。对了老师，您前面说的可以横向比较不同方法算出来的相互作用能，是怎样个比较法？一般可以 ...

可以低精度的方法和高精度的方法比

如果用了几种方法，可靠性都差不多或者很难说哪个更准，若它们能得到相同的结论，也算是相互印证

作者
Author: wweng 时间: 2016-12-21 12:10

sobereva 发表于 2016-12-21 12:08
可以低精度的方法和高精度的方法比

如果用了几种方法，可靠性都差不多或者很难说哪个更准，若它们能得 ...

谢谢老师的讲解，明白了。也对接下来要做的心里大致有了底，非常感谢

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