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标题: 求助：Gromacs统计数量密度怎么从盒子中心开始啊 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2024-7-28 08:57
标题: 求助：Gromacs统计数量密度怎么从盒子中心开始啊
各位老师，我在做气液界面的时候，想从盒子中心点开始统计各个组分的分布，如下图，但是gmx density好像只能从某个坐标轴开始，请问下图是怎么实现的啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-7-29 03:18
自己写VMD tcl脚本等方式统计。GROMACS没对应的命令

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）专门有一节非常系统、详细讲了VMD tcl脚本的编写并给出了巨量的例子。下面是课上用于类似问题的脚本
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作者
Author: xjw 时间: 2024-7-29 09:49

sobereva 发表于 2024-7-29 03:18
自己写VMD tcl脚本等方式统计。GROMACS没对应的命令

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.ke ...

收到，谢谢老师

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