最近想模拟一个NpT系综,看手册了解到 langevin 恒温器有fixed原子和langevin原子之分,
比如手册给的例子POSCAR中要写:Si H Si
40 16 8
那么是不是就意味着POSCAR中最下面八行的坐标就是这八个langevin atoms?
还是借用手册这个例子,如果写:Si H Si H
40 10 8 6
POSCAR最后14行是不是要为8个Si和6个H的坐标?
如果是我想的这样来指定langevin atoms,有没有大佬能分享一个按Z坐标从小到大重新编号原子的脚本呢?