计算化学公社

标题: 求助:bf4离子的itp问题 [打印本页]

作者
Author:
打豆豆的灰鸭    时间: 2024-7-29 15:05
标题: 求助:bf4离子的itp问题
本帖最后由 打豆豆的灰鸭 于 2024-7-29 15:26 编辑

老师能帮我看一下这个bf4离子的itp文件吗,在能量最小化的时候分子结构破坏
(, 下载次数 Times of downloads: 12) (, 下载次数 Times of downloads: 12)
参考文献
(, 下载次数 Times of downloads: 16) (, 下载次数 Times of downloads: 14)



作者
Author:
slxc920113    时间: 2024-7-29 15:12
gmx中能量的单位是kJ/mol,距离的单位是nm。所以你的力场数明显单位不对,导致数值偏小了,无法约束住bond。你需要诚意418.4
作者
Author:
打豆豆的灰鸭    时间: 2024-7-29 15:29
本帖最后由 打豆豆的灰鸭 于 2024-7-29 15:50 编辑
slxc920113 发表于 2024-7-29 15:12
gmx中能量的单位是kJ/mol,距离的单位是nm。所以你的力场数明显单位不对,导致数值偏小了,无法约束住bond ...

文献给的单位是Kcal/mol,把单位换乘了 Kj/mol,我乘了4.184
我乘了418.4,确实可以了,谢谢啦





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3