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标题: gmx distance统计离子间距离使用求助 [打印本页]

作者
Author: MINGYU97 时间: 2024-7-31 14:55
标题: gmx distance统计离子间距离使用求助
各位老师好，我在使用gmx distance 统计离子间距离时遇到了下面的错误：
Inconsistency in user input:
The number of positions to be merged are not compatible

(, 下载次数 Times of downloads: 20)
同样的命令在另一个体系的文件夹中却可以使用，想请教一下大家

作者
Author: MINGYU97 时间: 2024-7-31 15:07
刚刚尝试了发现是因为这个体系的锌离子和氯离子数目不一样。
那请问各位老师可以使用gmx distance来统计比如体系中某两类离子的平均距离吗，rdf图不是特别明显

作者
Author: chuanghao 时间: 2024-7-31 16:57

MINGYU97 发表于 2024-7-31 15:07
刚刚尝试了发现是因为这个体系的锌离子和氯离子数目不一样。
那请问各位老师可以使用gmx distance来统计比 ...

对于这个目的，可以用gmx pairdist实现

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