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标题: 请问Amber模拟过程中，怎么查看硬件瓶颈？从而调优最大化发挥性能？ [打印本页]

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Author: jyxsdj 时间: 2024-8-2 11:27
标题: 请问Amber模拟过程中，怎么查看硬件瓶颈？从而调优最大化发挥性能？
各位老师好！我是新入手训练的小白，电脑配置：CPU: AMD 7950X, 内存: 64GB, 显卡: RTX4080super; 软件配置：CUDA12.4, Amber24和AmberTools24，我运行一个配体和蛋白质的200ns模拟体系，共27425个原子，运行期间我分别用top和nvidia-smi命令查看，cpu占用率100%，显卡使用率86%，具体如下图。请问老师们，这是cpu是瓶颈了嘛？附件为坐标文件。

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