计算化学公社

标题: 求助CP2K跑铜表面柠檬酸根水溶液AIMD模拟的一些小问题 [打印本页]

作者
Author: qaz707000195 时间: 2024-8-2 22:07
标题: 求助CP2K跑铜表面柠檬酸根水溶液AIMD模拟的一些小问题
各位好，由于第一次采用CP2K跑铜表面柠檬酸根水溶液的AIMD任务，因此在产生输入文件的时候有一些问题导致跑不起来。体系是这个样子的，就想跑一下AIMD使其结构更加合理。但是由于没有经验，所以inp输入文件如下，跑的过程中会出错误，请各位大佬指教

作者
Author: qczcb2 时间: 2024-8-3 15:19
是scf不收敛吗？建议开smear，铜这种金属体系不开smear收敛比较困难。另外建议加上DFT-D3(BJ)，不影响收敛，但是对几何优化影响比较大，因为存在水分子和柠檬酸根的作用，以及表面吸附，只用PBE可能算不准

作者
Author: sobereva 时间: 2024-8-4 08:41
提问时始终主动说报错，别让别人猜

当前当YZ周期性很诡异，习俗上都让界面平行于XY
你这个体系当三维周期性很可能是更好的选择（取决于实际研究目的），能避免引入很厚的真空区大幅节约时间，而且slab两侧都与水接触，计算一些统计量的时候还可以两面取平均以减小统计误差。
如果没有特殊情况不要用NPE，温度都没法控制

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)