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标题: 请教关于两个自由基反应搜索过渡态的自旋多重度设置 [打印本页]

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scott__    时间: 2024-8-3 15:50
标题: 请教关于两个自由基反应搜索过渡态的自旋多重度设置
(, 下载次数 Times of downloads: 35)
各位前辈好,最近在两个自由基反应寻找过渡态,计算(E)-2-癸烯醛自由基与HOO·反应的过渡态时,无法计算出来过渡态,想了下会不会是自旋多重度的问题,想问下自旋多重度应该如何设置,谢谢大家。


下面是我的输入文件
%nprocshared=62
%mem=100GB
%chk=/data/home/scott/compute/R.chk
# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ub3lyp/6-311g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj int=superfine

Title Card Required

0 1
C                  6.45206031    0.35182304   -0.20211268
H                  6.52031492    0.12414551   -1.24537882
H                  6.30706832    1.40436525   -0.07549422
H                  7.35585018    0.05482537    0.28763853
C                  5.26172307   -0.40791077    0.41229907
H                  5.40671506   -1.46045297    0.28568062
H                  5.19346846   -0.18023323    1.45556522
C                  3.96094139    0.01954383   -0.29257650
H                  3.81594940    1.07208603   -0.16595804
H                  4.02919600   -0.20813370   -1.33584264
C                  2.77060415   -0.74018998    0.32183525
H                  2.70234954   -0.51251245    1.36510140
H                  2.91559614   -1.79273218    0.19521680
C                  1.46982246   -0.31273538   -0.38304032
H                  1.53807707   -0.54041292   -1.42630647
H                  1.32483047    0.73980682   -0.25642187
C                  0.27948523   -1.07246919    0.23137143
H                  0.21123061   -0.84479166    1.27463757
H                  0.42447721   -2.12501140    0.10475297
C                 -1.02129646   -0.64501460   -0.47350415
H                 -0.99838310   -0.33731626   -1.49805122
O                 -0.77834872    0.87790413    0.68226174
C                 -2.23501787   -0.65902947    0.22692849
H                 -2.25793176   -0.96673106    1.25147458
C                 -3.37970528   -0.28286654   -0.39336113
H                 -3.35679101    0.02483735   -1.41790652
C                 -4.71346574   -0.29827159    0.37634382
H                 -4.73638058   -0.60597896    1.40088815
O                 -5.77638918    0.05102611   -0.19963833
O                 -0.80495886    1.73939944    1.76741581
H                  0.04673792    2.17426093    1.85172516





作者
Author:
乐平    时间: 2024-8-3 15:57
通常,自由基与自由基之间的反应没有过渡态
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-8-3 16:16
此外,这个体系的单重态是开壳层单重态,必须做自旋对称性破缺
作者
Author:
scott__    时间: 2024-8-3 17:03
乐平 发表于 2024-8-3 15:57
通常,自由基与自由基之间的反应没有过渡态

嗯嗯,谢谢回复,我是想复现一下文献中的一个数据
作者
Author:
scott__    时间: 2024-8-3 17:05
本帖最后由 scott__ 于 2024-8-3 17:10 编辑
wzkchem5 发表于 2024-8-3 16:16
此外,这个体系的单重态是开壳层单重态,必须做自旋对称性破缺

谢谢回复,我好像不太懂什么是对称性破缺,我刚刚开始学习,这个我可以读一下什么文章
然后这个自旋多重度需要考虑如何设置嘛

作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-8-3 17:14
scott__ 发表于 2024-8-3 10:05
谢谢回复,我好像不太懂什么是对称性破缺,我刚刚开始学习,这个我可以读一下什么文章
然后这个自旋多重 ...

仔细阅读http://sobereva.com/82
作者
Author:
scott__    时间: 2024-8-3 19:34
wzkchem5 发表于 2024-8-3 17:14
仔细阅读http://sobereva.com/82

嗯嗯,谢谢老师指导

我刚刚开始学习这方面,我阅读了一下,把命令行修改成了如下,出现了错误,我该如何改正。再次感谢老师。
# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ub3lyp/6-311g(d,p) empiricaldispersion=gd3bj int=superfine guess=mix nosymm stable
作者
Author:
wjc404    时间: 2024-8-3 21:52
opt和stable不要在同个任务做。先用stable=opt找到稳定波函数,再读取它做opt。
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-8-4 00:03
scott__ 发表于 2024-8-3 12:34
嗯嗯,谢谢老师指导

我刚刚开始学习这方面,我阅读了一下,把命令行修改成了如下,出现了错误,我该如 ...

但凡问报错问题,必须给出完整的报错信息




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