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标题: Amber联用Gaussian 进行QM/MM模拟求助 [打印本页]

作者
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t675210552    时间: 2024-8-8 21:59
标题: Amber联用Gaussian 进行QM/MM模拟求助
本帖最后由 t675210552 于 2024-8-8 21:59 编辑

各位,近期研究一个酶促反应体系,刚好想借机会学习一下QM/MM模拟,但是计算不太顺利,在进行QM/MM MD模拟时,始终无法正确完成,查询一些信息也未能解决,遂求助各位老师,请不吝赐教。计算中gau_job.log报错信息如下图1截图,提交作业的文件如附件所示,我在看到MaxMem=  4026531840 信息时猜测是否我本地内存条太小限制,于是我租了个超算借点增大了qmmm_md.in中mem,还是有相同报错,目前进度卡住,还希望各位老师帮忙看看
作者
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abdoman    时间: 2024-8-9 07:15
没有用过QM/MM

但是看出错信息, "Did not find a xxx" 和Gau_job.tpl
感觉是不是要提供电荷和自旋的信息?


作者
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t675210552    时间: 2024-8-9 08:11
abdoman 发表于 2024-8-9 07:15
没有用过QM/MM

但是看出错信息, "Did not find a xxx" 和Gau_job.tpl

这个我在我的qmmm_md.in这个输入文件中进行了定义,不知道在gau_job.tpl中是否还需要再定义,我试一下 谢谢!





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