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标题: 计算RESP2电荷,对得到的真空下的分子chk文件进行freqchk时要求内存太大 [打印本页]

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szg    时间: 2024-8-21 20:06
标题: 计算RESP2电荷,对得到的真空下的分子chk文件进行freqchk时要求内存太大
我刚学gromacs不久,比较菜,今天在做模拟时,学习计算RESP2电荷,对DME_gas.chk进行freqchk操作时系统报错并要求2000,000MW以上的空间,谷歌搜了一圈没找到答案,请问一下各位老师这是什么原因,是我文件写错了还是配置不行,希望能得到老师的解答,生成chk文件的gjf文件如下所示:

%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%mem=16GB
%nprocs=12
# opt freq b3lyp/TZVP em=GD3BJ

DME

0 1
C                 -0.33003282    0.80841577   -0.00000172
H                  0.02676818    1.31276749    0.87362428
H                  0.02672853    1.31270774   -0.87367840
C                 -1.87003278    0.80876540    0.00003322
H                 -2.22683378    0.30441367   -0.87359278
H                 -2.22679412    0.30447342    0.87370991
O                  0.14632775   -0.53990934    0.00003358
O                 -2.34639334    2.15709051   -0.00000207
C                  1.57632771   -0.54023400    0.00000113
H                  1.93276534   -1.54912062    0.00002754
H                  1.93308906   -0.03594202   -0.87367555
H                  1.93312871   -0.03588228    0.87362713
C                 -3.77639331    2.15741516    0.00003038
H                 -4.13315465    1.65312319    0.87370706
H                 -4.13283093    3.16630179    0.00000397
H                 -4.13319431    1.65306344   -0.87359562

--link1--
%mem=16GB
%nprocs=12
%oldchk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME_gas.chk
# b3lyp/Def2TZVP em=GD3BJ geom=allcheck


--link1--
%mem=16GB
%nprocs=12
%oldchk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME.chk
%chk=C:\a_gromacs_examples\2M_DME\DME_solv.chk
# b3lyp/Def2TZVP em=GD3BJ scrf(read,SMD,solvent=1,1,2-TriChloroEthane) geom=allcheck

eps=7.1937
epsinf=2.1641


能用gaussian16正常运行并生成3个chk文件,对DME.chk进行freq操作可以正常执行,但DME_gas.chk和DME_solv.chk就会出错,报错情况如图:



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szg    时间: 2024-8-21 20:09
内置溶剂没有找到DME,用的1,1,2-TriChloroEthane代替,eps和epsinf都相近
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sobereva    时间: 2024-8-22 01:06
szg 发表于 2024-8-21 20:09
内置溶剂没有找到DME,用的1,1,2-TriChloroEthane代替,eps和epsinf都相近

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意

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sobereva    时间: 2024-8-22 01:08
分清楚formchk和freqchk,完全是两码事。下文根本就没提到freqchk的事

RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html


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szg    时间: 2024-8-22 09:13
sobereva 发表于 2024-8-22 01:08
分清楚formchk和freqchk,完全是两码事。下文根本就没提到freqchk的事

RESP2原子电荷的思想以及在Multiw ...

好的,谢谢老师
作者
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szg    时间: 2024-8-22 09:14
sobereva 发表于 2024-8-22 01:06
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

ok,以后一定注意




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