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标题: 分子动力学结果阴阳离子聚集 [打印本页]

作者
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执笔勾勒神话    时间: 2024-8-28 11:38
标题: 分子动力学结果阴阳离子聚集
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问题:  溶剂分子和阴离子力场文件按照上图步骤用的subtob 生成的,Li离子的力场文件用的gromacs 自带的kbff20.ff,为啥跑完分子动力学后出现阴阳离子聚集严重的现象???? (以下是具体mdp文件) 求各位老师指点。

作者
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sobereva    时间: 2024-8-28 16:10
没有叫subtob的东西
能截图的情况一律不要拍照
kbff20.ff根本不是GROMACS自带的
mdp也没上传

分清楚拓扑文件和力场文件,不是一回事





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