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标题: 进行位置限定时，原子序号发生变化 [打印本页]

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-8-28 15:30
标题: 进行位置限定时，原子序号发生变化
我在进行位置限定时，根据em.gro里面的原子序号进行选择，并生成对应的限制.itp。后面就遇到了问题，因为我的蛋白是由三条链组成的，最开始pdb2gmx后会分别生成3条链的itp文件，里面的原子序号和整体蛋白的gro文件里的序号对不上了，导致我位置限定出现错误。我应该怎么解决呢？
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作者
Author: sobereva 时间: 2024-8-28 15:59
自己用计算器，算出来每个分子里面该限制的原子的序号

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-8-28 19:47
sob老师，是从1开始计算吗？那我计算出来之后和itp如何对应呢？能否具体的讲一下

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