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标题: 多肽和大分子蛋白相互作用适合从量化的角度分析吗？ [打印本页]

作者
Author: Ruzhuang 时间: 2024-8-29 17:36
标题: 多肽和大分子蛋白相互作用适合从量化的角度分析吗？
我做的方向是多肽和大分子蛋白相互作用，前期用Alphafold Server做了多肽和大分子蛋白的分子对接，
也用Amber跑了MD,现在想从量化的角度去分析一下，
这样的想法可行吗，求大佬解答

作者
Author: xsc6 时间: 2024-8-30 01:27
主要看你想考察的问题和方向，分析局部之间的若相互作用是可以的，此外，你的字体好有意思，上次看到如此多的突出显示还是sob老师的博文

作者
Author: sobereva 时间: 2024-8-30 07:55
别弄那么大的高亮的红字，99.999%的人视力没问题
不要用《多肽和大分子蛋白相互作用》作为标题，正确使用书名号，否则会造成误导。这次给你改了，以后注意

用簇模型做量化计算，并结合Multiwfn做波函数分析，完全可以而且很常见。参看下文
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表！
http://sobereva.com/667（http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html）

作者
Author: Ruzhuang 时间: 2024-8-30 08:28
谢谢sob老师吗，感谢各位大佬批评指正

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