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标题: 模拟中钙离子会和磷酸根离子结合,如何编写TCL脚本,计算蛋白质一定范围内结合物数量 [打印本页]

作者
Author:
Willow0114    时间: 2024-8-29 21:48
标题: 模拟中钙离子会和磷酸根离子结合,如何编写TCL脚本,计算蛋白质一定范围内结合物数量
如题所示,在模拟过程中,添加的钙离子会和磷酸根离子结合,我想通过VMD计算出距离蛋白质一定范围内的结合物数量变化,应该如何写TCL脚本呢?

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-8-30 08:09
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里我写的这个脚本,举一反三
(, 下载次数 Times of downloads: 9)

用到的选择语句参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html




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