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标题: 求助：MD模拟不用反应力场，能不能输出species文件 [打印本页]

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Author: pumpkin111 时间: 2024-9-3 09:19
标题: 求助：MD模拟不用反应力场，能不能输出species文件
用机器学习训练的神经网络势文件在lammps内跑MD模拟，不能直接用fix reaxff/species命令，还有没有其他方法输出小分子产物的数量演变呢？我尝试过用reacnetgenetor处理，但是生成的.species文件中都是各种各样的键随时间的变化，而不是分子类型及数量随时间的变化。请问是我的模型有问题吗？或者还需要做一些额外的处理呢？
我实际上得到的是这样的文件：

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