计算化学公社

标题: 请教MS中castep或者dmol3的电荷如何导出到第三方作图软件问题 [打印本页]

作者
Author: plsf 时间: 2024-9-4 17:38
标题: 请教MS中castep或者dmol3的电荷如何导出到第三方作图软件问题
各位老师好，请教一下win系统中在castep或者castep里面算完的电荷，比如差分电荷，如何才能导出到vesta c4d 或者3d max这样的作图软件中，每次导出的只有晶体，没有电荷分布，一直没找到方法，请问有老师知道吗

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-9-4 23:46
1、castep好像有个工具叫c2x，可以将castep的check产生其他格式的密度网格，如xsf，这样就能在vesta里面处理。
2、dmol3的网格是通过grd文件，那个可能得自己写脚本/程序来转换到cube或者xsd。
3、实际上每次产生完的等值面的segment或者体素数据的field或者可能在xsd文件当中也有保存，不过我没研究过具体是个怎样的格式，xsd格式本身比较神秘，不太推荐折腾这个事情。

作者
Author: plsf 时间: 2024-9-5 21:27

卡开发发发表于 2024-9-4 23:46
1、castep好像有个工具叫c2x，可以将castep的check产生其他格式的密度网格，如xsf，这样就能在vesta里面处 ...

谢谢老师，c2x是linux系统里面一个方法，确实win系统目前方法较少，组里不是纯计算组，目前只会ms，所以只能搞ms

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-9-5 23:16

plsf 发表于 2024-9-5 21:27
谢谢老师，c2x是linux系统里面一个方法，确实win系统目前方法较少，组里不是纯计算组，目前只会ms，所以 ...

那也许你可以试试Henkelman组bader程序页面上附带的那个玩意den2vasp。这程序只有一个单独的f90源码，你可以在windows下用visual studio或者cygwin环境之类的用fortran编译器编译，使用方法你可以看他们的页面，我没有测试过是否好用，不确定有什么bug。

作者
Author: plsf 时间: 2024-9-6 09:24

卡开发发发表于 2024-9-5 23:16
那也许你可以试试Henkelman组bader程序页面上附带的那个玩意den2vasp。这程序只有一个单独的f90源码，你 ...

嗯，好的，老师，非常感谢您的帮助

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