计算化学公社

标题: 三重态的轨道该怎么画? [打印本页]

作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-4 18:44
标题: 三重态的轨道该怎么画?
各位老师:
      大家好!我用TD-B3LYP 计算出一个三重态的电子结构(关键词B3lyp/GENECP td(full,trip)),我发现这个体系的轨道在高斯view上有三种画法:1,选择单重态则能画出单重态结构图1a电子结构;选择三重态(restricted)则画出图1b电子结构,选择三重态(unristricted)则画出图1c的电子结构。
      我想用Sob老师的Multiwfn结合vmd画出这个体系的电子结构,结果发现Multiwfn产生出来的轨道是1a这种情况(图2)
      我的问题是究竟那种画法正确?我个人倾向于画法2(图1b),按理来说就是将图1c相应的alpha轨道与beta-轨道组合到一块就是图1b。
      另外一个问题是如何用Multiwfn读取正确的三重态轨道?最好直接读取成为图1b这种形式方便画图。若不能,至少应该读成图1c这种结构,然后将相应的alph轨道与beta-轨道组合到一块,形成图1b的这种电子结构对应的轨道。相应的图见附件。感谢各位老师的指导。

作者
Author:
zjxitcc    时间: 2024-9-4 19:14
展示输入文件(除坐标外的所有信息)
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-4 19:20
zjxitcc 发表于 2024-9-4 19:14
展示输入文件(除坐标外的所有信息)

非常感谢老师的回复!
#p b3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=water)  em=gd3 td(triplet,full)

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6-311G**
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作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-4 19:28
本帖最后由 BinWang 于 2024-9-4 19:29 编辑
zjxitcc 发表于 2024-9-4 19:14
展示输入文件(除坐标外的所有信息)

老师您好我发现改成这种输入方式,用高斯view看不同的设置下还是会出现图1a-c这样的效果,但用Multiwfn读出来的却是图1c的结果
#p ub3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=water)  em=gd3

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.....cord

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作者
Author:
zjxitcc    时间: 2024-9-4 19:56
不用选来选去,您做了很多错误/不合理操作。GaussView看轨道的面板里,Calculation里的东西都不要动,这一行上面的Charge和Spin也不能改,打开是什么就是什么;看轨道是点击Visualize,然后选择相应的轨道,最后点击Update,等待轨道等值面的显示。什么1b, 1c都不用看了。

3L的关键词 对应的fch文件里是基态单重态(S0)的轨道。4L的关键词 对应的fch文件里是最低三重态(T1)的轨道。
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-4 20:33
你的计算根本没定义赝势,结果毫无意义,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

Multiwfn里alpha和beta序号的记录规则、选取方式,下文写明了
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html


作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-4 21:02
本帖最后由 BinWang 于 2024-9-4 21:06 编辑
sobereva 发表于 2024-9-4 20:33
你的计算根本没定义赝势,结果毫无意义,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
ht ...

非常感谢Sob老师指点,我下面少抄了两行,这样应该没问题吧?
#p ub3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=water)  em=gd3
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作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-5 11:00
BinWang 发表于 2024-9-4 21:02
非常感谢Sob老师指点,我下面少抄了两行,这样应该没问题吧?
#p ub3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=wat ...

没问题
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-5 19:26
sobereva 发表于 2024-9-5 11:00
没问题

非常感谢Sob老师
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-5 19:28
zjxitcc 发表于 2024-9-4 19:56
不用选来选去,您做了很多错误/不合理操作。GaussView看轨道的面板里,Calculation里的东西都不要动,这一 ...

非常感谢老师的回复
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-7 17:39
sobereva 发表于 2024-9-4 20:33
你的计算根本没定义赝势,结果毫无意义,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
ht ...

#p b3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=water)  em=gd3 td(triplet,full)

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Sob老师您好!用上面这种方式计算得到的fchk文件,用Multiwfn只能load出单重态的轨道,这是什么原因啊,我明明计算的是三重态,我要用这一个文件同时画出空穴-电荷图,以及三重态的轨道
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-9-7 17:41
BinWang 发表于 2024-9-7 10:39
#p b3lyp  genecp scrf=(smd,solvent=water)  em=gd3 td(triplet,full)

name

因为Multiwfn作的是基态的轨道,你这个计算只有激发态是三重态
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-7 17:45
wzkchem5 发表于 2024-9-7 17:41
因为Multiwfn作的是基态的轨道,你这个计算只有激发态是三重态

非常感谢老师的回复,这样的话我这个体系没办法用上面的方法算出来的fchk文件利用multiwfn画分子轨道图了吗?
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-7 18:43
sobereva 发表于 2024-9-4 20:33
你的计算根本没定义赝势,结果毫无意义,仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
ht ...

Sob老师,还有一个问题,我根据您的帖子做三重态的空穴-电子图,图几乎看不清楚,不知道什么原因啊?
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-7 23:17
BinWang 发表于 2024-9-7 17:45
非常感谢老师的回复,这样的话我这个体系没办法用上面的方法算出来的fchk文件利用multiwfn画分子轨道图了 ...

你画的只能是单重态基态的分子轨道
TDDFT算三重态激发态的过程不会再额外产生一套轨道

注意看北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)这页ppt
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-7 23:18
BinWang 发表于 2024-9-7 18:43
Sob老师,还有一个问题,我根据您的帖子做三重态的空穴-电子图,图几乎看不清楚,不知道什么原因啊?

在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-8 08:11
sobereva 发表于 2024-9-7 23:17
你画的只能是单重态基态的分子轨道
TDDFT算三重态激发态的过程不会再额外产生一套轨道

非常感谢Sob老师的回复!
      还有一个问题就是画三重态的轨道时是alpha轨道与beta轨道成对出现的,是不是应该把这一对alpha与beta轨道拼在一块画出来啊?而不是单独画出alpha与对应的beta轨道。
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-9-8 10:32
BinWang 发表于 2024-9-7 11:43
Sob老师,还有一个问题,我根据您的帖子做三重态的空穴-电子图,图几乎看不清楚,不知道什么原因啊?

“看不清楚”意义不明,至少也得上传图片,我们看看是怎么个不清楚法
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-9-8 10:56
BinWang 发表于 2024-9-8 08:11
非常感谢Sob老师的回复!
      还有一个问题就是画三重态的轨道时是alpha轨道与beta轨道成对出现的,是 ...

UKS计算三重态时,alpha和beta并不严格配对,有时候序号相同的alpha和beta的轨道图形和能量差异都极大
先搞清楚UKS是什么,并且仔细把此文看了
用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用
http://sobereva.com/448http://bbs.keinsci.com/thread-11377-1-1.html


作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-9 12:29
wzkchem5 发表于 2024-9-8 10:32
“看不清楚”意义不明,至少也得上传图片,我们看看是怎么个不清楚法

非常感谢老师的回复!我整理一下再发您
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-9 12:34
sobereva 发表于 2024-9-8 10:56
UKS计算三重态时,alpha和beta并不严格配对,有时候序号相同的alpha和beta的轨道图形和能量差异都极大
...

非常感谢sob老师的指点
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-9 13:31
sobereva 发表于 2024-9-8 10:56
UKS计算三重态时,alpha和beta并不严格配对,有时候序号相同的alpha和beta的轨道图形和能量差异都极大
...

非常感谢Sob老师的指点
作者
Author:
BinWang    时间: 2024-9-21 18:30
sobereva 发表于 2024-9-7 23:17
你画的只能是单重态基态的分子轨道
TDDFT算三重态激发态的过程不会再额外产生一套轨道

非常感谢Sob老师




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