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标题: 组装体二级结构分析 [打印本页]

作者
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xingyu7087    时间: 2016-12-28 12:43
标题: 组装体二级结构分析
在Gromacs上跑出了一个由双亲性短肽分子(端基被非肽有机分子保护的短肽分子)组装成的纳米结构,然后想利用DSSP统计该纳米结构中存在的二级结构,由于分子中的非肽片段无法被DSSP识别,请问怎么才能得到这种情况下的二级结构信息呢?谢谢!

作者
Author:
sobereva    时间: 2016-12-28 13:46
用VMD看看能否判断出二级结构。能的话,用自带的timeline插件就可以绘制各个残基二级结构随时间的变化图




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