计算化学公社

标题: 高斯计算效率和顺序问题 [打印本页]

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-28 16:17
标题: 高斯计算效率和顺序问题
请问将任务提交到工作站后，工作站如何确定计算任务的顺序？是先计算X（nproc=X）大的任务吗？如果提交的任务太多（nproc=X 提交任务X的总数大于工作站的实际核数）计算效率是不是会降低。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-12-28 16:52
有多少个物理核心（不包括超线程）就提交多少核的任务，或者提交(物理核心/2)的两个任务，类推。

如果工作站没有排队系统，那么提交上去的作业自提交时起就在同步运行。如果总运行核数超过核心数（如10核的机器上提交了好多个10核任务），会造成其间争抢资源，效率很可能不如依次运行。如果有任务排队系统，看排队系统的设置决定运行顺序。

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-28 18:24

liyuanhe211 发表于 2016-12-28 16:52
有多少个物理核心（不包括超线程）就提交多少核的任务，或者提交(物理核心/2)的两个任务，类推。

如果工 ...

谢谢，我这边的工作站好像没有排队系统，但是发现提交的任务总运行核数超过核心数时，任务中写nproc=X，X越大时这个任务就会一直在运行，而其他的任务就会交错着运行，请问有没有排队系统推荐的，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-28 19:35

那丢失的发表于 2016-12-28 18:24
谢谢，我这边的工作站好像没有排队系统，但是发现提交的任务总运行核数超过核心数时，任务中写nproc=X，X ...

有10个逻辑核心，用7个线程并行，则7个线程的计算会在10个核心之间动态分配，由系统自动调度。这显然和X越大优先级越高完全不是一码事。
Linux下任务优先级通过nice来设，windows下在任务管理器里面能设。

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-28 19:50

sobereva 发表于 2016-12-28 19:35
有10个逻辑核心，用7个线程并行，则7个线程的计算会在10个核心之间动态分配，由系统自动调度。这显然和 ...

谢谢社长

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-12-28 21:21

那丢失的发表于 2016-12-28 18:24
谢谢，我这边的工作站好像没有排队系统，但是发现提交的任务总运行核数超过核心数时，任务中写nproc=X，X ...

我们自己用的SGE，自己搭的，比较容易配置、使用。超算上用的排队系统很多，不过我不用超算，PBS好像比较常用

作者
Author: 那丢失的 时间: 2016-12-28 21:25

liyuanhe211 发表于 2016-12-28 21:21
我们自己用的SGE，自己搭的，比较容易配置、使用。超算上用的排队系统很多，不过我不用超算，PBS好像比较 ...

谢谢

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