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标题: 求助:请问怎么把xyz轨迹文件转化为.car文件然后分割为小的轨迹文件 [打印本页]

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pumpkin111    时间: 2024-9-6 15:07
标题: 求助:请问怎么把xyz轨迹文件转化为.car文件然后分割为小的轨迹文件
我尝试用MS将xyz轨迹文件转化为.car文件。奇怪的是,导入的xyz文件有10帧,但是输出的car文件只有一帧,这是为什么呢?而且由于对于轨迹文件进行后处理时,文件大会导致报错,因此想把car文件分割成小文件,比如说将一个100多帧的文件每30帧分成一个小的car文件,请问除了复制粘贴还有其他办法吗?

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含光君    时间: 2024-9-6 16:52
为啥要用MS处理轨迹,VMD不好嘛
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pumpkin111    时间: 2024-9-6 17:05
含光君 发表于 2024-9-6 16:52
为啥要用MS处理轨迹,VMD不好嘛

是因为后续处理只能处理.car文件。我很少用VMD,但是VMD好像不能输出car文件吧。我还有个问题,请问为什么我导入的是轨迹文件,但是MS输出的只有一帧呢
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pumpkin111    时间: 2024-9-6 17:16
含光君 发表于 2024-9-6 16:52
为啥要用MS处理轨迹,VMD不好嘛

而且我还尝试用别的可视化软件将轨迹文件保存为其他形式,还是只有一帧,这是为什么呢?是我操作与什么问题吗?
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含光君    时间: 2024-9-6 21:20
pumpkin111 发表于 2024-9-6 17:16
而且我还尝试用别的可视化软件将轨迹文件保存为其他形式,还是只有一帧,这是为什么呢?是我操作与什么问 ...

car文件好像本来就只能一帧哇,MS里的轨迹格式是xtd
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chenzhe    时间: 2024-9-7 20:50
含光君 发表于 2024-9-6 21:20
car文件好像本来就只能一帧哇,MS里的轨迹格式是xtd

可以多帧,多帧car导入ms自动转xtd
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chenzhe    时间: 2024-9-7 20:50
用ase可转




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