计算化学公社

标题: 使用Multiwfn的300功能下的1号子功能如何得到平滑后格点数据算出的自由体积呢？ [打印本页]

作者
Author: shaun1234 时间: 2024-9-7 22:07
标题: 使用Multiwfn的300功能下的1号子功能如何得到平滑后格点数据算出的自由体积呢？

在阅读了Sob老师的教程：使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域的博文（http://sobereva.com/539）后，发现Multiwfn输出的自由区域面积是通过原始格点数据计算得到的，请问各位老师，如果想得到根据平滑后格点数据计算的自由区域面积，该如何通过Multiwfn实现呢？谢谢各位老师解答!

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-7 23:07
原理上没法用平滑后格点数据算。如果你是指计算平滑化后的格点数据的等值面内的体积，那是严重依赖于等值面数值的选取的，有任意性，不适合定义孔洞体积。

作者
Author: shaun1234 时间: 2024-9-8 13:39

sobereva 发表于 2024-9-7 23:07
原理上没法用平滑后格点数据算。如果你是指计算平滑化后的格点数据的等值面内的体积，那是严重依赖于等值面 ...

原来是这样，谢谢sob老师解答！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)