计算化学公社

标题: 穷本科生4000元喜提单路7K62 [打印本页]

作者
Author: HydroKagami 时间: 2024-9-9 16:53
标题: 穷本科生4000元喜提单路7K62
本帖最后由 HydroKagami 于 2024-9-24 14:10 编辑

上个月在论坛发帖，讨论2000元如何装一台不错的服务器跑第一性原理计算，和许多老师交流了意见。几周内我又从父母亲戚在内的各种途径筹款2000元，以四千元的预算装机
恰好看到wxyhgk老师安装的双路7k62服务器，豁然开朗，恰好在我购买的时候，7K62跌到了恐怖的1680元，遂迅速购入并组装
主板也是捡了个大漏，1350元从某硬件群群友处买来一张h11ssl-c，便精准的将预算控制在了4000左右
配置表：
CPU：EPYC 7K62 1680元
主板：超微H11SSL-c 1350元
内存：海力士8G REG DDR4 x8 total 64G 416元（砍价得到）
散热：利民TR-TA120EX 279元
硬盘：铠侠RC20 512G 265元
电源：长城巨龙1250W 235元
机箱：以前玩剩下的机箱
共：4225元

安装过程相当不顺利，奉劝组装epyc的各位一定要有一把可设扭矩的t20电动螺丝刀或者amd官方螺丝刀，否则会像我一样遇到各种例如缺通道和装不上系统的玄学问题
最后安装了Ubuntu 24.04，编译了vasp6.4.2，计算速度相当快

作者
Author: wcy鱼饵 时间: 2024-9-9 17:28
等后续体验感受了

作者
Author: pikachuupup 时间: 2024-9-9 18:46
看起来不错，散热情况如何

作者
Author: HydroKagami 时间: 2024-9-9 22:01

pikachuupup 发表于 2024-9-9 18:46
看起来不错，散热情况如何

利民的这个散热器相当不错，噪音也不大，因为epyc面积大，配合好一点的硅脂不会太热

作者
Author: HydroKagami 时间: 2024-9-9 22:01

wcy鱼饵发表于 2024-9-9 17:28
等后续体验感受了

目前一切安好，在考虑要不要装slurm队列系统

作者
Author: TZL 时间: 2024-10-9 10:25
你有一个很好的开始，我本科的时候还在玩泥巴呢。不知道你是否要选择科研，你现在刚起步，但你未来的科研的方向一定要慎重选择

作者
Author: HydroKagami 时间: 2024-10-9 11:30

TZL 发表于 2024-10-9 10:25
你有一个很好的开始，我本科的时候还在玩泥巴呢。不知道你是否要选择科研，你现在刚起步，但你未来的科研的 ...

已经决定了以后要走第一性原理计算这条路了，算电催化吧，打算争一争保研之类的，弄个直博

作者
Author: hdsk 时间: 2024-10-28 00:04

HydroKagami 发表于 2024-9-9 22:01
目前一切安好，在考虑要不要装slurm队列系统

这个slurm不是集群上用的吗？单个服务器也能用？那怎么划分主节点和计算结点

作者
Author: snljty2 时间: 2024-10-28 10:21

hdsk 发表于 2024-10-28 00:04
这个slurm不是集群上用的吗？单个服务器也能用？那怎么划分主节点和计算结点

SLURM的管理节点和计算节点可以是同一个节点，单个节点也可以装上用于方便管理排队之类的。正常配置的话大多数时候SLURM的CPU占用可以忽略，不影响性能。

作者
Author: hdsk 时间: 2024-10-28 17:13

snljty2 发表于 2024-10-28 10:21
SLURM的管理节点和计算节点可以是同一个节点，单个节点也可以装上用于方便管理排队之类的。正常配置的话 ...

这样啊。那我也打算装一个，方便提交任务。不知道好装不

作者
Author: snljty2 时间: 2024-10-28 19:47

hdsk 发表于 2024-10-28 17:13
这样啊。那我也打算装一个，方便提交任务。不知道好装不

不太讲究的话，直接包管理器装就行，比如RockyLinux 8下。

# 尝试
dnf config-manager --set-enabled powertools
dnf install libaec
dnf config-manager --set-disabled powertools
dnf install slurm slurm-slurmd slurm-slurmctld
# ubuntu
# apt install munge
# apt install slurm-wlm slurmctld slurmd
# /etc/selinux/config 将SELINUX改为disable
systemctl stop firewalld
systemctl disable firewalld
iptables -t nat -F
iptables -t filter -F
# 管理节点
create-munge-key
systemctl enable munge
systemctl restart munge
systemctl status munge
# edit /etc/slurm/slurm.conf
# edit /etc/slurm/gres.conf
# 同步各节点/etc/munge/munge.key
# 别忘了改/etc/hostname和/etc/hosts让各个节点互相认识节点名
systemctl start slurmd
systemctl status slurmd
systemctl enable slurmd
systemctl start slurmctld
systemctl status slurmctld
systemctl enable slurmctld
slurmd -C # check computing nodes information

复制代码

作者
Author: hdsk 时间: 2024-10-28 20:30

snljty2 发表于 2024-10-28 19:47
不太讲究的话，直接包管理器装就行，比如RockyLinux 8下。

哇~ 谢谢谢谢

作者
Author: DaMin32767 时间: 2024-11-14 10:33
太有实力了，未来可期

作者
Author: chuexue_hu 时间: 2024-11-18 17:37

HydroKagami 发表于 2024-10-9 11:30
已经决定了以后要走第一性原理计算这条路了，算电催化吧，打算争一争保研之类的，弄个直博

哈喽，大佬你好，我也是本科生在做DFT计算，能认识交流一下吗

作者
Author: hz_hz 时间: 2024-12-1 23:05
您好，请教一下这个计算vasp电催化表面吸附，60个原子左右，优化要多久呢，十分感谢

作者
Author: HydroKagami 时间: 2024-12-2 15:44

hz_hz 发表于 2024-12-1 23:05
您好，请教一下这个计算vasp电催化表面吸附，60个原子左右，优化要多久呢，十分感谢

看你初始建模怎么样，如果化学直觉还行的话，我算差不多原子的体系应该几个小时，当然也得看这个体系的电子结构复杂程度

作者
Author: hz_hz 时间: 2024-12-27 10:07

HydroKagami 发表于 2024-12-2 15:44
看你初始建模怎么样，如果化学直觉还行的话，我算差不多原子的体系应该几个小时，当然也得看这个体系的电 ...

好的，我目前也装了7k62，挺暖和的哈哈哈

作者
Author: Picardo 时间: 2025-1-3 22:29

snljty2 发表于 2024-10-28 19:47
不太讲究的话，直接包管理器装就行，比如RockyLinux 8下。

谢谢分享

作者
Author: Picardo 时间: 2025-1-3 22:29
请问这主板有没有mos过热的问题，很多人说超微h11 280w以上的u mos很容易报警

作者
Author: 15127175701 时间: 2025-2-12 14:37
可以搞电催化这方向南开大学陈院士就弄这个的方向不错

作者
Author: HydroKagami 时间: 2025-3-10 15:10

Picardo 发表于 2025-1-3 22:29
请问这主板有没有mos过热的问题，很多人说超微h11 280w以上的u mos很容易报警

目前没有遇到过

作者
Author: 林家清染 时间: 2025-3-25 17:39

hdsk 发表于 2024-10-28 00:04
这个slurm不是集群上用的吗？单个服务器也能用？那怎么划分主节点和计算结点

目前单个机器可以装一个,先用着,将来再买一个电脑就直接组集群了

作者
Author: songelin 时间: 2025-4-30 14:19
各位大佬，新人刚找到组织，原谅还不能私信。我也刚接触计算，想学一下计算，后期可能会用到MD。主要是想手搓一台机器，可以推一下靠谱的那啥么？对了，我的方向主要是锂电有机无机复合电解质的相关计算模拟，之前学过一点MS, 现在想换一种软件，有没有建议。十分感谢！

作者
Author: JianyuC 时间: 2025-4-30 15:27

songelin 发表于 2025-4-30 14:19
各位大佬，新人刚找到组织，原谅还不能私信。我也刚接触计算，想学一下计算，后期可能会用到MD。主要是想手 ...

唯一参考：http://sobereva.com/444中”6 GPU加速做分子动力学的推荐配置“
然后根据自己实际情况修改

作者
Author: songelin 时间: 2025-4-30 16:31

JianyuC 发表于 2025-4-30 15:27
唯一参考：http://sobereva.com/444中”6 GPU加速做分子动力学的推荐配置“
然后根据自己实际情况修改

感谢回复，我再去细细研读。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)