计算化学公社

标题: 用gauss view画二聚体后用高斯16正常优化完，振子强度很小是什么原因呀？ [打印本页]

作者
Author: wgl 时间: 2024-9-10 09:58
标题: 用gauss view画二聚体后用高斯16正常优化完，振子强度很小是什么原因呀？
想求助一下，最近想分析二聚体的荧光特性，先是优化单体，用优化好的单体构型在gauss view里面画二聚体分子，生成的.gjf文件，用高斯16进行结构优化，任务正常结束，但是为啥振子强度特别小啊？不知道是哪一步出现了问题，是初始构型选的不对吗？

作者
Author: wgl 时间: 2024-9-10 09:59
log文件太大了，放不上去，放的截图

作者
Author: cokie 时间: 2024-9-10 16:12
不合理的地方太多了（大概从优化完单体之后的操作都不太合理），可以先搜搜excimer/exciplex发光的文章了解一下，有几点建议也许可以供你参考。

i> 首先分子可扭转部分较多，结构很“崎岖”，因此直觉上，在分散相里，大概率分子间很难形成excimer/exciplex，不知道是如何判断分子存在“二聚体发光”，一般这个发光峰会相较单体红移+structureless
ii> 如果该双分子发光是在分散相里观测到的，那么最好用构象搜索的方法来确定二聚体构象；如果该双分子发光是在凝聚相里观测到的，那么最好以晶体中二聚体的结构作为初始构型做QM/MM计算。
iii> 一般激基复合物发光都有电子转移特征，所以用B3LYP算出的发光无论是振子强度还是波长都不准，建议范围分离或者w调控的泛函或者双杂化泛函。

作者
Author: wgl 时间: 2024-9-10 17:21

cokie 发表于 2024-9-10 16:12
不合理的地方太多了（大概从优化完单体之后的操作都不太合理），可以先搜搜excimer/exciplex发光的文章了解 ...

你好，感谢解答，这个分子是实验中已经合成的分子，实验中观测到在水溶液中有AIE（聚集诱导发光）现象，想通过理论计算的方式解释一下，看了不少文献都是通过算二聚体的方式来反映聚集态，看了sob老师关于构象搜索的帖子，现在通过molclus软件确定的初始构型，想问一下改用wb97xd泛函6-31g(d,p)基组合适吗？

作者
Author: cokie 时间: 2024-9-10 22:18

wgl 发表于 2024-9-10 17:21
你好，感谢解答，这个分子是实验中已经合成的分子，实验中观测到在水溶液中有AIE（聚集诱导发光）现象， ...

水中AIE的话，常规文献通常选择两种模式来搭建聚集体的模型。
第一种是养单晶，然后从单晶中抠出一个团簇来进行后续的模拟计算。（可以看看sob老师这篇博文，大概了解一下如何选择合适的簇模型http://sobereva.com/597）
第二种是通过跑分子动力学，模拟出一个分子聚集体，然后从中选取合适的团簇进行后续处理。

但无论哪种方法，对于普通AIE分子，发光大都只体现单分子发光的特征，你当前做的这种模拟，并不适合传统AIE分子。

作者
Author: WYY@ 时间: 2024-9-11 11:33
本帖最后由 WYY@ 于 2024-9-11 11:41 编辑

如果是单体用优化完的结构算的S1的振子强度小呢？也是因为结构不合理吗？还是说方法和泛函什么的选的不对啊

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