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标题: 求助：Gromacs模拟Zn金属和电解液的界面快照 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2024-9-12 16:04
标题: 求助：Gromacs模拟Zn金属和电解液的界面快照
各位老师，我利用Gromacs模拟锌金属和电解液的界面得到如下快照，为什么最后在界面处明显看到电解液出现分布不均的现象啊（如图框中所示）

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-12 17:23
体现了液体与表面的相互作用特征

作者
Author: xjw 时间: 2024-9-12 17:57

sobereva 发表于 2024-9-12 17:23
体现了液体与表面的相互作用特征

谢谢老师回复，那在模拟过程中这个是正常对吗？

作者
Author: pu1p 时间: 2024-9-12 20:41
请问能否分享下em和prod的.mdp文件，我在模拟固液界面能量最小化的时候一直无法收敛

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-13 02:22

xjw 发表于 2024-9-12 17:57
谢谢老师回复，那在模拟过程中这个是正常对吗？

正常

作者
Author: xjw 时间: 2024-11-8 20:47
本帖最后由 xjw 于 2024-11-8 20:50 编辑

sobereva 发表于 2024-9-13 02:22
正常

老师您好，我在做界面模拟的时候，做了加正向电压和反向电压以及不加电压三种情况，但是这三种情况计算出来的分子在z轴上的密度分布相差很小，如下图1，这个情况正常吗？我本来想的是加不同方向电压带电荷的离子分布具有较大的差异，我在文献中看到有较大差异如图2

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