计算化学公社

标题: 求助通常使用简化模型以替换实际模型的文献 [打印本页]

作者
Author: han- 时间: 2024-9-13 09:15
标题: 求助通常使用简化模型以替换实际模型的文献
各位老师，“在 DFT 计算中，通常使用简化模型以替换实际模型”这句话，有没有相关文献的支撑？如何有依据的回复审稿人？

作者
Author: dnlx 时间: 2024-9-13 09:55
读一下这篇，看看是不是可以参考：

Yonder et al., 2020. Can small polyaromatics describe their larger counterparts for local reactions? A computational study on the H-abstraction reaction by an H-atom from polyaromatics. J. Phys. Chem. A 124, 9626–9637.

作者
Author: han- 时间: 2024-9-13 10:14

dnlx 发表于 2024-9-13 09:55
读一下这篇，看看是不是可以参考：

Yonder et al., 2020. Can small polyaromatics describe their larg ...

感谢回复，我主要是想简化反应的催化剂模型，反应物还是不大的

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-13 15:07
不需要引用任何文献，这都是司空见惯的常识性知识。审稿人质疑你的情况仅会发生在你简化的方式不当的情况下

作者
Author: han- 时间: 2024-9-13 17:29

sobereva 发表于 2024-9-13 15:07
不需要引用任何文献，这都是司空见惯的常识性知识。审稿人质疑你的情况仅会发生在你简化的方式不当的情况下

好的 sob老师

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-13 17:40
顺带说一个合理简化模型的例子。以下两篇博文里介绍了我研究8字型双环分子对18碳环的吸附的文章Phys. Chem. Chem. Phys., 25, 16707 (2023)和Chem. Commun., 59, 9770 (2023)
8字形双环分子对18碳环的独特吸附行为的量子化学、波函数分析与分子动力学研究
http://sobereva.com/674（http://bbs.keinsci.com/thread-38312-1-1.html）
理论设计新颖的基于18碳环构成的双马达超分子体系
http://sobereva.com/684（http://bbs.keinsci.com/thread-39132-1-1.html）

文中要在昂贵的wB97M-V/def2-QZVPP级别下计算8字形分子与18碳环的相互作用能，然而直接算太过于昂贵，所以如Phys. Chem. Chem. Phys., 25, 16707 (2023)文中的补充材料所示，我将8字形分子只保留了和18碳环有明显相互作用的一边，而另一侧就给砍掉了，这令计算容易得多，又不会带来明显的计算误差

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