按VMD手册，在VMD的命令行里输入"rock < x | y | z > by <step> <n>"（比如"rock y by 0.1"）即实现当前场景的自动旋转，输rock off可关闭。不过经过探索发现此命令不太直观，需要一些解释：
< x | y | z >三选一代表旋转轴，但是并非所加载结构的红绿蓝三色坐标轴，而是相对屏幕固定的坐标轴；
<step>代表旋转速度，但是设为1都转得有点快了，绝对值在0.2以下比较合适，而且当前是命令行窗口在前还是结构窗口在前还对应不太一样的速度；
<n>可写可不写，不写则持续一个方向旋转，写则正反两方向在一定幅度内往复旋转，但是往复旋转的角度区间并非n自己定而是n与step共同确定。
旋转方向由旋转轴和step的正负号按右手定则确定，当step为正时，右手大拇指往旋转轴方向指，其他四指自然弯曲的方向就是旋转方向。x相应于屏幕水平向右，y相应于屏幕竖直向上（与主窗口Extensions-Visualization-Movie Maker里的Movie Settings-Rotation about Y axis一致），z相应于垂直指出屏幕向外（就是指向自己）。不清楚有无可能设置别的旋转轴方向。