计算化学公社
标题:
gmx自带dssp导出dat数据绘图问题
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作者Author:
一条空空的河
时间:
2024-9-13 20:47
标题:
gmx自带dssp导出dat数据绘图问题
如题,题主使用的是gmx2024.01版本,自带gmx dssp,使用指令为:gmx dssp -s md02.tpr -f md02_fit.xtc -o dssp.dat -num dssp.xvg -b 0 -e 100000 -tu ps 导出xvg文件默认为二级结构随时间变化图,如何将dat文件转化为目前常见的dssp结果图呢?感谢!
作者Author:
Kiteliberator
时间:
2025-3-11 17:42
想知道您这个问题怎么解决的
作者Author:
remake
时间:
2025-12-23 16:46
请问解决这个问题了吗,求教!
作者Author:
huchao
时间:
2025-12-24 20:32
楼主您好,我在使用gmx dssp 遇到了同样的问题,生成的xvg和dat文件不知道该如何分析,请问您这解决了吗?
作者Author:
remake
时间:
2025-12-29 10:27
https://github.com/Jerkwin/gmxtools?tab=readme-ov-file
其中的dssp2gp可用于dssp.dat的绘制
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