计算化学公社

标题: 模拟力场和水模型的选择是否会影响体系RMSD的计算结果 [打印本页]

作者
Author: 一个梨 时间: 2024-9-14 12:13
标题: 模拟力场和水模型的选择是否会影响体系RMSD的计算结果
为什么与文献一样，模拟同一种蛋白质在相同的溶剂环境进行相同时长的ns模拟，模拟完成后经计算得到的RMSD曲线图会大不相同，有哪些因素可能会导致它们之间的差别？

作者
Author: Loading0760 时间: 2024-9-14 12:56
详见博文《谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因》
http://sobereva.com/678

别说是力场和水模型不同了,我就算是相同力场相同水模型,同样的结构,重复多次也会因为随机种子的问题,出现偏差.

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)