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标题: Intel 14代CPU 14700K 大小核运行gromacs最佳效率求助 [打印本页]

作者
Author: ccccc123 时间: 2024-9-15 11:05
标题: Intel 14代CPU 14700K 大小核运行gromacs最佳效率求助
本帖最后由 ccccc123 于 2024-9-15 11:14 编辑

Intel 14700K是8P核+12E核设计，共28线程，GPU是4090D
1:看了各位老师做的测试，了解到单显卡单任务调用12核左右效率最高，gmx mdrun -s * -ntmpi 1 -ntomp 12 -pin on -update gpu
2:如果确实想同时运行2个任务，应该如何设置-pinoffset的值？
gmx mdrun -s * -ntmpi 1 -ntomp 12 -pin on -pinoffset 0
gmx mdrun -s * -ntmpi 1 -ntomp 12 -pin on -pinoffset 12 请问各位老师这样设置是否可行？
【如果不行】该如何设置？
【如果可行】第1个任务会利用0-11个P核，那第2个任务会利用多个E核，这样是否会造成第二个任务效率过低？

作者
Author: ccccc123 时间: 2024-9-18 10:04
@Entropy.S.I 老师可否指教一下，不胜感激

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2024-9-18 10:18
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2024-9-18 10:23 编辑

1. 我不知道你看的是谁的测试，我公布的测试结果显示在使用CPU计算成键项时只保留1-2个E-Core速度最快。虽然我公布的是13900KF的测试结果，但14700K(F)在架构上并没有本质差异，且我自己搭了包含6台14700KF+4090D的集群，测试结论与之前一致。

2. 在1块GPU上运行2个job启用MPS可获得更高的性能。每个job使用14个逻辑核心，具体分配方式采用(7P*2)+(1P*2+12E)还是2*(4P*2+6E)，需看实际需求，后者可以确保两个job速度一致。

3. 多任务应考虑使用slurm进行调度。

4. RaptorLake架构的CPU应当注意将主板更新到最新版本BIOS以防止CPU急速老化。

作者
Author: ccccc123 时间: 2024-9-18 11:44

Entropy.S.I 发表于 2024-9-18 10:18
1. 我不知道你看的是谁的测试，我公布的测试结果显示在使用CPU计算成键项时只保留1-2个E-Core速度最快。虽 ...

非常感谢老师的回复
其中1是看的这篇测试，http://bbs.keinsci.com/thread-13861-1-1.html

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2024-9-18 11:49
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2024-9-18 11:52 编辑

ccccc123 发表于 2024-9-18 11:44
非常感谢老师的回复
其中1是看的这篇测试，http://bbs.keinsci.com/thread-13861-1-1.html

早就过时了，从软件、硬件方面来说都过时了

阅读：
http://bbs.keinsci.com/thread-33296-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-35986-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-39266-1-1.html

作者
Author: ccccc123 时间: 2024-9-18 15:19

Entropy.S.I 发表于 2024-9-18 11:49
早就过时了，从软件、硬件方面来说都过时了

阅读：

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