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标题: 求助关于计算水滴与水层的质心距离 [打印本页]

作者
Author: behemoth 时间: 2024-9-18 20:18
标题: 求助关于计算水滴与水层的质心距离
各位老师好，我是GROMACS初学者，我做的是石油方向的油相与水的模型，在最近想复现的一个文献中，既有水层与油相形成的界面，又有油相中的水滴，电场作用下，水滴会向界面聚结，我想计算水滴与水层之间的质心距离，现在有一个疑问。
跪求大佬解答：我不知道这些水原子中，哪些属于水层里，哪些属于水滴里的，是需要再定义几个组吗，跪求大佬解答

作者
Author: DOUKUN 时间: 2024-10-8 15:36
想问一下，原文献是什么呢？关于分组，可以用tcl脚本去识别，或者打开gro文件通过z轴坐标的不同，去区分液滴和油水界面的区别。

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