计算化学公社

标题: 求助如何实现对无机盐溶液的宽频光谱模拟 [打印本页]

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ughsuvu    时间: 2024-9-19 10:17
标题: 求助如何实现对无机盐溶液的宽频光谱模拟
本帖最后由 ughsuvu 于 2024-9-19 10:21 编辑

各位前辈们好,最近的课题需要我完成一项工作,计划去计算得到尿素溶液0.1-300THz(1-10000微米)波段的吸收/反射光谱,原本计划是委外去建模+测量,对方表示Gaussian可做,感觉这个软件比较好上手于是决定自己学学,想请问下:
1.单纯的Gaussian软件是否可以完成该任务?
2.由于太赫兹波段光谱的吸收峰主要是由分子间力影响,隐式溶剂模型不能实现对氢键的模拟,目前了解到的是可以使用显式溶剂模型,也就是直接在溶质分子周边添加水分子。参考了论坛中其他大佬分享的构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)。能否用该方式建模后直接导入Gaussian或其他软件去求光谱?
3.宽频光谱如何设置?是否需要做什么额外的计算呀?

本人非化学专业科班出身,目前是安全工程专业研二的学生,导师在做物探,跨的比较远,这个课题也是从组内前辈手里接下来的,个人觉得是个挺好的点。希望各位大佬可以指点一二,帖子内问题描述可能有些不专业的地方,非常惭愧

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sobereva    时间: 2024-9-20 05:46
Gaussian根本不能做,对方要么没常识要么在忽悠你

需要用CP2K跑动力学,然后做傅里叶变换得到振动谱,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里讲第一性原理动力学的部分介绍了做法。这种任务耗时极高,如果没像样的计算条件就算了。要么更糙一些,用GROMACS基于分子力场跑动力学。
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ughsuvu    时间: 2024-9-21 17:37
sobereva 发表于 2024-9-20 05:46
Gaussian根本不能做,对方要么没常识要么在忽悠你

需要用CP2K跑动力学,然后做傅里叶变换得到振动谱,北 ...

非常感谢老师的解惑,我再去查找些文献深入学习!!!




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