计算化学公社
标题:
求助,关于辣根过氧化物酶拓扑文件的生成
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作者Author:
mbbbbb
时间:
2024-9-20 10:12
标题:
求助,关于辣根过氧化物酶拓扑文件的生成
本帖最后由 mbbbbb 于 2024-9-20 10:24 编辑
老师好,最近在做一个关于辣根过氧化物酶的模拟,初步设想是将酶中的铁卟啉单独提取出来,然后利用sobtop生产拓扑文件,把铁卟啉视为配体。但是酶中的铁卟啉与其中的氨基酸残基有一个配位键,请问这么做可行吗
作者Author:
sobereva
时间:
2024-9-20 18:34
需要自己修改拓扑信息给相应的配位键加上bond相关的项
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