计算化学公社

标题: 学校超算上安装orca计算报错,找不到libmpi.so.40,求助解决方案 [打印本页]

作者
Author:
wayneLiu    时间: 2024-9-20 22:51
标题: 学校超算上安装orca计算报错,找不到libmpi.so.40,求助解决方案
之前安装orca都是在本地服务器上安装使用,因此没有遇到什么安装的问题,但是这次在新服务器上安装orca时遇到了。。。具体如下:
学校超算上的软件环境为:
1、操作系统:Rocky Linux 8.6
2、编译器:GCC/Intel
      --gcc version 8.5.0
      --Intel oneAPI 2023(包含Intel MPI),modulefiles路径:/share/opt/moduledeps
3、调度软件:Slurm

无法使用root权限。
按照sob老师的教程安装后,计算后报错(图1和图2),.bashrc信息(图3),ps:超算上已经安装fortran

作者
Author:
乐平    时间: 2024-9-20 23:11
本帖最后由 乐平 于 2024-9-20 23:14 编辑

大概率你没有在超算上 module load gcc 9 或者更高的版本

另外,没必要在 ~/.bashrc 里写 module load XXX,直接在命令行里 module load XXX 就行了。
即使以后在提交任务时需要调用 XXX 编译环境,也只用在提交任务的脚本里写 module load XXX,而不用在 ~/.bashrc 里写 module load XXX

作者
Author:
wayneLiu    时间: 2024-9-20 23:25
乐平 发表于 2024-9-20 23:11
大概率你没有在超算上 module load gcc 9 或者更高的版本

另外,没必要在 ~/.bashrc 里写 module load X ...

[lxy1syz2lb@manage1 ORCATEST]$ module avail
----------------------------------- /share/opt/moduledeps ------------------------------------
intel/2023.2.0  sharemdf  

------------------------------- /usr/share/Modules/modulefiles -------------------------------
dot  module-git  module-info  modules  null  use.own  

-------------------------------- /share/software/modulefiles ---------------------------------
go-1.21.4  singularity-3.8.7  

Key:
loaded  modulepath  
[lxy1syz2lb@manage1 ORCATEST]$
好像没有gcc....
作者
Author:
abin    时间: 2024-9-21 10:24
平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm

相关介绍可以查阅: https://gitee.com/hpc4you/apps


作者
Author:
wayneLiu    时间: 2024-9-21 11:22
abin 发表于 2024-9-21 10:24
平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

我看到了,多谢大佬,我研究一下
作者
Author:
wayneLiu    时间: 2024-9-21 18:00
abin 发表于 2024-9-21 10:24
平台上有apptainer/singularity的话,
可以用这个, 下载就能用.

老师您好,请问这个有orca6的吗,5.4版本跟6有些部分不太兼容
作者
Author:
xxqcn    时间: 2024-10-30 10:57
MPI的问题吧.





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3