计算化学公社

标题: 创建索引，提示One of your groups is not ascending [打印本页]

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-9-23 10:52
标题: 创建索引，提示One of your groups is not ascending
如题所示，我想要将PO4与Water_and_ions合在一起创建个组，提示错误 (, 下载次数 Times of downloads: 3) ，但是我将PO4和CA离子组成一个组是没有问题的， (, 下载次数 Times of downloads: 4) ，这是为什么呢？如果这里设置成功生成了一个新的组叫PO4_water_and_ions，那么在npt.mdp文件中，"tc-grps = Protein Water_and_ions"也要对应改为"tc-grps = Protein PO4_water_and_ions"吗？

作者
Author: student0618 时间: 2024-9-23 11:55
本帖最后由 student0618 于 2024-9-23 11:57 编辑

试试分别选那些组water, ca, po4, ...？或者直接用原子序号选。
是的，觉得太长可在make ndx 分好组后给那组改个名字。

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-9-23 15:20

student0618 发表于 2024-9-23 11:55
试试分别选那些组water, ca, po4, ...？或者直接用原子序号选。
是的，觉得太长可在make ndx 分好组后给那 ...

非常感谢

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