计算化学公社

标题: 氢原子转移反应的过渡态IRC跑三个点就结束了求助 [打印本页]

作者
Author: ChengZi00 时间: 2024-9-25 08:30
标题: 氢原子转移反应的过渡态IRC跑三个点就结束了求助
如图所示，计算的是羟自由基进攻葡萄糖1号碳上的氢发生氢原子转移反应的过渡态。首先采用ub3lyp/6-31+g(d,p) scrf=(pcm,solvent=water) opt=modredundant进行羟基的氧原子与葡萄糖1号碳上的氢原子进行键角柔性扫描，得到的能量最高点进行ub3lyp/6-31+g(d,p) scrf=(pcm,solvent=water) opt=(ts,calcfc,noeigen) freq过渡到态搜寻，虚频方向对的。最后采用ub3lyp/6-31+g(d,p) scrf=(pcm,solvent=water) irc(calcfc) guess=read 进行IRC搜索后每次都只跑3步数，采用了tight int=ultrafine跑过渡态，步长改15跑IRC也是三步数停止，步长改20时收敛失败。请问各位老师应该怎么操作。

作者
Author: 乐平 时间: 2024-9-25 09:33

羟自由基进攻葡萄糖1号碳上的氢发生氢原子转移反应的过渡态

你的目标是让葡萄糖1号碳上的氢和 OH 生成 H2O 分子吗？
如果是，那么从你贴的第3张图来看，过渡态可能还没找到，1号碳上 C-H 之间的距离可能还太近，OH 上的 O 和 1号碳上的 H 之间的距离还太远。

作者
Author: ChengZi00 时间: 2024-9-25 10:35
目标是生成H2O分子。老师，这是他的震动的样子，从这张图上来看应该可以生成H2O分子吧

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-25 22:08
该说的都说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html）
明确说了，opt和IRC的积分格点设置必须严格一致
另外，牵扯到分子内弱相互作用，最好加上D3
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413

对于加大步长，可以进一步测试30。SCF不收敛该怎么解决怎么解决
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

作者
Author: ChengZi00 时间: 2024-9-27 03:12

sobereva 发表于 2024-9-25 22:08
该说的都说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400（http://bbs.keinsci.com/t ...

谢谢sob老师！

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