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标题: 关于过渡态搜索的计算能量的选择和振动频率分析的结构选择 [打印本页]

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Author: 桂の猿 时间: 2024-9-25 12:16
标题: 关于过渡态搜索的计算能量的选择和振动频率分析的结构选择
老师好

我最近在做反应过渡态的搜索
反应为A+B=C
大致做法如下
1. 给出基元反应的初始态R1和终了态R12（A，B，C均分别作了结构优化）
2.利用DZVP+DFTD3（BJ）进行路径搜素（设置了12个replica）
3.得到了过渡态结构R6          此时根据路径文件得到的能量为E6

然后
在初始态R1和过渡态R6之间存在最低能量态R2 （两个分子有些许结构变化，记作A2和B2）  此时根据路径文件得到的能量为E2
在过渡态R6和终了态R12之间存在最低能量态R10  （C10  已经基本是产物的结构了）       此时根据路径文件得到的能量为E10

然后
利用energy，
计算得到R6的能量E6'
分别计算得到R2中A2和B2的能量EA'和EB'，E2'=EA'+EB'
计算得到R10的能量E10'

现在我要做台阶图，但是发现
E6-E2≠E6’-E2'
E10-E6≠E10’-E6'

问题一
所以请问老师，我应该选在哪一组作为台阶图的能量？
应该是1）过渡态搜索得到的能量还是 2）根据energy模块计算得到的能量

问题二
在上述基础上，我要做温度影响分析，所以要做振动频率分析
我在做振动频率分析时，对于反应物有以下两种选择
1）直接对R2整体进行计算，得到G
2）分开对R2中的A和B进行计算，得到G后加和

谢谢老师

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