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标题: 求助：如何在vmd TK console 中绘制不同的球体 [打印本页]

作者
Author: 每天打工十小时 时间: 2024-9-26 15:14
标题: 求助：如何在vmd TK console 中绘制不同的球体
老师们，我最近在vmd中想画两个球体：比如一个为坐标{0 0 0} 半径 10 ，颜色为红色，不透明度为1 ；另一个为 {1 1 1} 半径 10 ，颜色为黄色，不透明度为0.5；每一次我设置第二个球体的材质的时候，会覆盖掉第一个球体的材质。
我的代码如下：
draw color red
draw material Opaque
graphics top sphere {0 0 0} radius 10 resolution 80

material add xxx
material change opacity xxx 0.5
draw color yellowdraw material xxx
graphics top sphere {1 1 1} radius 10 resolution 80
这个问题似乎在与我进行一些命令的时候并没有指定绘制在哪一个图层上，但我确实不太了解这部分功能。希望大家能够帮助我。
此外还要请教一下大家，当我load轨迹与结构文件之后，想要将每一帧的resname aaa的质心画出来，看一下他们是怎么运动的。
谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-9-26 22:46
定义一个新材质，绘制第二个时候用新材质

举一反三
显示粒子运动轨迹的VMD脚本
http://sobereva.com/65

作者
Author: 每天打工十小时 时间: 2024-10-31 17:46

sobereva 发表于 2024-9-26 22:46
定义一个新材质，绘制第二个时候用新材质

举一反三

解决啦，非常感谢您。
第一个问题，可以通过创建新的空白“分子”，然后通过在不同的molid上进行绘制。
第二个问题，老师的脚本写的很清楚。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2024-11-4 12:26
确实，VMD可以对同一id内graphics绘制出的不同形状分别定义颜色，但不能分别定义材质而只能共用一个，邮件列表这帖也有提到分不同id绘制的补救方法，只能说是个不足吧。类似的还有绘制的形状在id内所有帧中显示而不能自定义显示帧号，有一个两个帖子提到用跟踪帧号、播放时每帧重新绘制的补救方法，若绘制的形状复杂一点就很容易耗费大量时间、减慢播放速度。如果还能期待VMD更新版本的话，挺希望加上这些功能。

作者
Author: 每天打工十小时 时间: 2024-11-9 14:43
在使用过程中确实也遇到了您描述的情况，感谢您的分享。

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